部徽說明：
1.海錨係屬海軍。
2.齒輪代表後勤修護人員以支援艦艇修造，完成艦艇妥善及各項後勤支援為主要使命。
3.稻穗代表補給人員以完成物料整備，支援修艦任務。
4.部徽以海錨、齒輪及稻穗合為一體，象徵精進後勤修護能量、支援艦隊、廠艦合作、修補合一之精神。
單位沿革：
海軍基隆後勤支援指揮部原隸屬海軍後勤司令部，係由原海軍第三軍區司令部及海軍第三造船廠配合「精實案」於88年7月1日合併編成，將海軍第三軍區司令部之港務隊、汽車隊修訂為基隆港務隊、基隆汽車隊，並與海軍第三造船廠五號塢同時改隸「海軍基隆後勤支援指揮部」。
復於89年3月16日增編基隆工程隊，並將海軍東引基地指揮部、馬祖基地指揮部改隸海軍基隆後勤支援指揮部。94年10月1日東引基地指揮部、馬祖基地指揮部移編改隸海軍艦隊司令部；95年海軍後勤司令部裁撤，海軍基隆後勤支援指揮部改隸直屬國防部海軍司令部。97年2月4日海軍保修指揮部編成後，再改隸屬海軍保修指揮部。
海軍基隆後勤支援指揮部擔任基隆港守備區基地防衛作戰與安全防護指揮管制任務，平時依艦艇修護計劃負責艦艇維修及能量整建，對本軍北部地區與東引、馬祖外島、陸岸單位之後勤支援與軍需品接轉、庫儲、運補及預算財務、軍品會計之處理及協調支援轄區內友軍離島運補作業，並依令支援責任區內緊急災害（難）防救任務。