部徽說明：
1.海錨係屬海軍。
2.齒輪代表後勤修護人員以支援艦艇修造、完成艦艇妥善及各項後勤支援為主要使命。
3.稻穗代表補給人員以完成物料整備，支援修艦任務。
4.部徽以海錨、齒輪及稻穗合為一體，象徵精進後勤修護能量、支援艦隊、廠艦合作、修補合一之精神。
單位沿革：
海軍蘇澳後勤支援指揮部位於蘇澳鎮北方澳，三面環山，東臨太平洋，地勢險峻，為一風景優美之狹地。民國58年依本軍精誠2、3號兵棋推演結論建議：「海軍兵力運用重點應部份轉移至臺灣東北部，並考量蘇澳港為海軍基地」。民國59年奉先總統 蔣公裁示執行，民國61年7月1日正式開工，代名「龍淵計畫」由海軍蘇澳基地工程處負責施工。海軍為感懷先總統 蔣公之高瞻遠囑及關愛德澤，特命名為「中正軍港」。
為配合艦隊進駐需要及發揮建港最大效益，於戰時成為海軍作戰指揮及後勤支援中心， 67年8月1日成立「海軍蘇澳造船廠」隸屬海軍後勤司令部。73年10月20日命名為「海軍第五造船廠」。84年9月1日中正基地指揮部裁撤，成立海軍一六八艦隊。86年1月16日擴編編制為師級，88年7月1日成立「海軍蘇澳造船廠」，將修械及電子等兩工場同時移交海軍戰鬥系統工廠，成立蘇澳維修站。
由於東部戰略及能量提升，89年4月1日成立「海軍蘇澳後勤支援指揮部」，於89年5月10日實施編成典禮，人員由原五百餘人增加至七百餘人。95年後令部裁撤，改隸屬國防部海軍司令部，迄97年2月4日海軍保修指揮部編成後，再改隸屬海軍保修指揮部。
海軍蘇澳後勤支援指揮部擔任蘇澳港守備區基地防衛作戰與安全防護指揮管制任務，平時依艦艇修護計劃負責艦艇維修及能量整建、對本軍東部地區陸岸單位之後勤支援、與軍需品接轉、庫儲、運補及預算財務，軍品會計之處理及協調支援轄區內友軍離島運補作業，並依令支援責任區內緊急災害（難）防救任務。
後勤工作為本軍整體戰力重要的一環，全體官兵員工除深切體認艱鉅外並本著精實、時效、主動、服務後勤團隊精神，充實專業技能，落實教育訓練，以提升修護能量，達成支援艦隊保衛海疆之目標。