組織沿革簡介
本隊係海軍為強化東部海域兵力配置，於民國84年9月1日成立「第二巡防艦隊」，隸屬「艦隊司令部」，駐地為蘇澳中正基地，接替原中正基地指揮部防衛作戰任務，下轄二三一戰隊及、二五一戰隊；配合陽字型驅逐艦汰除期程，及寧陽、宜陽艦返國成軍，正式定編，下轄二三一戰隊(濟陽、鳳陽、汾陽、蘭陽)、二五一戰隊(海陽、淮陽、寧陽、宜陽)、艦隊部(作戰科、修護科、補給科、主計科、行政科、政綜科)、支援隊、蘇澳作戰中心；94年12月17日基隆、蘇澳軍艦返國成軍，基隆軍艦隸屬二五一戰隊，蘇澳軍艦隸屬二三一戰隊；95年5月16日配合二六一戰隊編成，基隆、蘇澳軍艦同時改隸二六一戰隊。103年11月1日「精粹案」艦隊整併實施計畫，原二六一戰隊併編後，基隆、蘇澳軍艦編入二三一戰隊，左營、馬公軍艦編入二五一戰隊。
本軍基隆級艦原為美海軍Ｋidd級飛彈驅逐艦,該四艦1981年3月起陸續成軍，加入美國海軍戰鬥序列。2001年美國布希政府核准對台軍售,將四艦售予我國,本軍「光華七號計劃」建案後,四艦於美國南卡羅萊納州道頓船廠執行啟封,並命名為基隆、蘇澳、左營、馬公軍艦。94年12月17日,基隆、蘇澳軍艦完成成軍典禮,正式加入海軍作戰序列,左營、馬公軍艦自95年11月1日起成軍服勤。編成時期:本隊係海軍為利六二部隊後續兵力運用,使兵力調度更具彈性,並發揮基隆級艦優異性能,95年4月1日核定成立,駐地為蘇澳中正基地,任務負責所屬各艦作戰指揮、整備、演訓及行政管理督導,並遂行戰隊各屬艦輔訓、輔修任務,依令支援負責區內緊急災害(難)防救任務。103年9月30日奉國防部令頒「精粹案」艦隊整併計畫，原二六一戰隊併編後併入一六八艦隊，基隆、蘇澳軍艦編入二三一戰隊，左營、馬公軍艦編入二五一戰隊以利人力管理及任務分配，於103年11月1日生效。