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第一任司令 林鎮夷上將
任期：民國95年2月17日至96年5月21日
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第二任司令 王立申上將
任期：民國96年5月21日至98年5月21日
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第三任司令 高廣圻上將
任期：民國98年5月21日至100年5月16日
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第四任司令 董翔龍上將
任期：民國100年5月16日至102年8月1日
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第五任司令 陳永康上將
任期：民國102年8月1日至104年1月30日
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第六任司令 李喜明上將
任期：民國104年１月30日至105年6月1日
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第七任司令 黃曙光上將
任期：民國105年6月1日至109年1月16日
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第八任司令 劉志斌上將
任期：民國109年1月16日至111年6月16日
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第九任司令 梅家樹上將
任期：民國111年6月16日至112年5月1日