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第一任海軍總長 黃鍾瑛            

任期：民國元年1月3日至元年3月29日

第二任海軍總長熙威上將軍 劉冠雄

任期：民國元年3月30日至5年6月30日

第三任海軍總長 程璧光           

任期：民國5年6月30日至6年6月23日

第四任海軍總長熙威上將軍 劉冠雄

任期：民國6年7月15日至8年12月3日

第五任海軍總長肅威上將軍 薩鎮冰

任期：民國8年12月3日至10年5月14日

第六任海軍總長遠威將軍 李鼎新

任期：民國10年5月14日至13年10月31日

第七任海軍總長 林建章            

任期：民國13年11月至14年12月31日

第八任海軍總長瀛威將軍 杜錫珪
任期：民國14年12月31日至16年6月