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新制海軍第一任兼總司令 陳誠上將

任期：民國35年7月l日至37年8月25日

第二任總司令 桂永清上將

任期：民國37年8月25日至41年4月15日

第三任總司令 馬紀壯上將

任期：民國41年4月16日至43年7月l日

第四任總司令 梁序昭上將

任期：民國43年7月1日至48年2月1日

第五任總司令 黎玉璽上將

任期：民國48年2月1日至54年1月25日

第六任總司令 劉廣凱上將

任期：民國54年l月25日至54年8月16日

第七任總司令 馮啟聰上將

任期：民國54年8月16日至59年7月l日

第八任總司令 宋長志上將

任期：民國59年7月l日至65年7月l日

第九任總司令 鄒堅上將

任期：民國65年7月1日至72年5月16日

第十任總司令 劉和謙上將

任期：民國72年5月16日至77年6月1日

第十一任總司令 葉昌桐上將

任期：民國77年6月1日至81年5月1日

第十二任總司令 莊銘耀上將

任期：民國81年5月1日至83年4月16日

第十三任總司令 顧崇廉上將

任期：民國83年4月16日至86年4月16日

第十四任總司令 伍世文上將

任期：民國86年4月16日至88年2月l 日

第十五任總司令 李傑上將

任期：民國88年2月l日至91年2月1日

第十六任總司令苗永慶上將

任期：民國91年2月1日至94年2月1日

第十七任總司令 陳邦治上將

任期：民國94年2月l日至95年2月16日

第十八任總司令 林鎮夷上將

任期：民國95年2月16日至95年2月17日